Механизм Генерального секретаря по осуществлению оперативного расследования в ответ на доведенные до его сведения сообщения о возможном применения химического, бактериологического (биологического) и токсинного оружия был разработан в конце 1980-х годов. Реагируя на запрос со стороны любого государства-члена Генеральный секретарь обязан инициировать расследование, включая направление группы по установлению фактов на место (места) возможного инцидента (инцидентов), и подготовить соответствующий доклад для всех государств — членов Организации Объединенных Наций. Его цель заключается в том, чтобы с помощью научных методов объективно установить подлинность фактов возможного нарушения Женевского протокола 1925 года, запрещающего использование химического и биологического оружия, или других соответствующих положений обычного международного права.

Предоставленный государствами-членами реестр экспертов и лабораторий и руководящие принципы и процедуры проведения расследований составляют ключевые элементы Механизма. В сентябре 2006 года государства-члены призвали Генерального секретаря обновить реестр экспертов и лабораторий, а также доступные ему технические руководящие принципы и процедуры, с целью обеспечить своевременное и эффективное расследование возможного использования.
Управление по вопросам разоружения вместе с государствами-членами работает над обновленной версией реестра экспертов и лабораторий, а также технических приложений к руководящим принципам и процедурам, чтобы обеспечить их полное соответствие стремительным и существенным изменениям, которые произошли в биологической сфере после 1980-х годов, а также учет вступления в силу Конвенции по химическому оружию (КХО) и создания Организации по запрещению химического оружия (ОЗХО) в 1997 году.

В 2007 году Управление по вопросам разоружения провело два заседания группы экспертов с участием представителей ряда соответствующих международных организаций. Группа обсуждала обновления к руководящим принципам и процедурам от 1989 года. Она приняла решение оставить основной документ от 1989 года без изменений и признала, что широкий процесс рассмотрения его действия должен обязательно включать прямое участие государств-членов. Группа подготовила обновленную версию приложений к руководящим принципам и процедурам, в которой особенно учитывались изменения в биологической сфере. Обновленная версия приложений

В соответствии с текущими руководящими принципами и процедурами «любое заинтересованное государство-член может запросить у Генерального секретаря проведение соответствующих специальных занятий или курсов, предусмотренных для квалифицированных экспертов, в целях поддержания их возможной функции по проведению от его лица расследований возможного использования химических, биологических и токсинных веществ для получения общего понимания ситуации и выработки плана действий». Первый учебный курс для экспертов был организован правительством Швеции и проведен в сотрудничестве с УВР в г. Умео, Швеция с 25 мая по 5 июня 2009 года.

Для того чтобы способствовать сотрудничеству и повысить технический потенциал расследований на предмет возможного применения такого оружия Организация Объединенных Наций и Всемирная организация здравоохранения подписали Меморандум о взаимопонимании, касающийся вопросов поддержки ВОЗ механизма Генерального секретаря для расследования возможного применения такого оружия.